Quercus L. Cinsine Ait Türlerde Kloroplast DNA'ya Ait psbA-trnH IGS Bölgesinin Kullanılarak Filogenetik İlişkilerin Değerlendirilmesi

dc.contributor.authorYılmaz, Aykut
dc.date.accessioned2023-04-10T20:23:54Z
dc.date.available2023-04-10T20:23:54Z
dc.date.issued2020
dc.departmentRektörlük, Rektörlüğe Bağlı Birimler, Düzce Üniversitesi Dergilerien_US
dc.description.abstractKloroplast genoma ait psbA-trnH IGS bölgesi, en fazla nükleotid dizi farklılığı içeren bölgelerden biriolmasından dolayı barkodlama amacı ile bitkilerde sıklıkla kullanılan bölgelerden biridir. Bu amaçla meşelerdevar olan taksonomik problemlerin çözümüne katkı sağlamak ve türler arasındaki filogenetik ilişkilerideğerlendirmek adına bu bölge bu çalışmada tercih edilmiştir. İlk olarak psbA-trnH IGS bölgesine ait sekansbilgisi analizler için NCBI’den sağlanılmıştır. Daha sonra bu sekanslar hizalandırılmış ve varyasyon gösterenbölgeler için bir bazın diğerine değişim oranları, transisyon/transversiyon oranları, baz frekansları gibi analizlerMEGA X programı kullanılarak yapılmıştır. Son olarak, türlerin birbirleri ile olan filogenetik ilişkilerinideğerlendirmek adına Neighbor-joining dendrogram hazırlanmış ve analiz edilmiştir. Bu bölgenin meşetürlerinin seksiyonel ayrımı için yeterli varyasyona sahip olmasına karşın, tür ayrımında ve tanımlamasındasekans varyasyonlarının yetersiz kaldığı görülmüştür. Çalışmanın sonucu olarak psbA-trnH IGS sekansınınmeşelerde barkodlama amacı ile tek başına yetersiz olduğu, bununla birlikte farklı barkodlama bölgeleri ilekullanımının fayda sağlayacağı önerilmektedir.en_US
dc.identifier.doi10.29130/dubited.637842
dc.identifier.endpage1192en_US
dc.identifier.issn2148-2446
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage1185en_US
dc.identifier.trdizinid390333en_US
dc.identifier.urihttp://doi.org/10.29130/dubited.637842
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/390333
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12684/11618
dc.identifier.volume8en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.relation.ispartofDüzce Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.titleQuercus L. Cinsine Ait Türlerde Kloroplast DNA'ya Ait psbA-trnH IGS Bölgesinin Kullanılarak Filogenetik İlişkilerin Değerlendirilmesien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
11618.pdf
Boyut:
662.42 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text