Quercus L. Cinsine Ait Türlerde Kloroplast DNA'ya Ait psbA-trnH IGS Bölgesinin Kullanılarak Filogenetik İlişkilerin Değerlendirilmesi
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2020
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Kloroplast genoma ait psbA-trnH IGS bölgesi, en fazla nükleotid dizi farklılığı içeren bölgelerden biriolmasından dolayı barkodlama amacı ile bitkilerde sıklıkla kullanılan bölgelerden biridir. Bu amaçla meşelerdevar olan taksonomik problemlerin çözümüne katkı sağlamak ve türler arasındaki filogenetik ilişkilerideğerlendirmek adına bu bölge bu çalışmada tercih edilmiştir. İlk olarak psbA-trnH IGS bölgesine ait sekansbilgisi analizler için NCBI’den sağlanılmıştır. Daha sonra bu sekanslar hizalandırılmış ve varyasyon gösterenbölgeler için bir bazın diğerine değişim oranları, transisyon/transversiyon oranları, baz frekansları gibi analizlerMEGA X programı kullanılarak yapılmıştır. Son olarak, türlerin birbirleri ile olan filogenetik ilişkilerinideğerlendirmek adına Neighbor-joining dendrogram hazırlanmış ve analiz edilmiştir. Bu bölgenin meşetürlerinin seksiyonel ayrımı için yeterli varyasyona sahip olmasına karşın, tür ayrımında ve tanımlamasındasekans varyasyonlarının yetersiz kaldığı görülmüştür. Çalışmanın sonucu olarak psbA-trnH IGS sekansınınmeşelerde barkodlama amacı ile tek başına yetersiz olduğu, bununla birlikte farklı barkodlama bölgeleri ilekullanımının fayda sağlayacağı önerilmektedir.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Kaynak
Düzce Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
8
Sayı
1
