Quercus L. Cinsine Ait Türlerde Kloroplast DNA'ya Ait psbA-trnH IGS Bölgesinin Kullanılarak Filogenetik İlişkilerin Değerlendirilmesi

Yükleniyor...
Küçük Resim

Tarih

2020

Dergi Başlığı

Dergi ISSN

Cilt Başlığı

Yayıncı

Erişim Hakkı

info:eu-repo/semantics/openAccess

Özet

Kloroplast genoma ait psbA-trnH IGS bölgesi, en fazla nükleotid dizi farklılığı içeren bölgelerden biriolmasından dolayı barkodlama amacı ile bitkilerde sıklıkla kullanılan bölgelerden biridir. Bu amaçla meşelerdevar olan taksonomik problemlerin çözümüne katkı sağlamak ve türler arasındaki filogenetik ilişkilerideğerlendirmek adına bu bölge bu çalışmada tercih edilmiştir. İlk olarak psbA-trnH IGS bölgesine ait sekansbilgisi analizler için NCBI’den sağlanılmıştır. Daha sonra bu sekanslar hizalandırılmış ve varyasyon gösterenbölgeler için bir bazın diğerine değişim oranları, transisyon/transversiyon oranları, baz frekansları gibi analizlerMEGA X programı kullanılarak yapılmıştır. Son olarak, türlerin birbirleri ile olan filogenetik ilişkilerinideğerlendirmek adına Neighbor-joining dendrogram hazırlanmış ve analiz edilmiştir. Bu bölgenin meşetürlerinin seksiyonel ayrımı için yeterli varyasyona sahip olmasına karşın, tür ayrımında ve tanımlamasındasekans varyasyonlarının yetersiz kaldığı görülmüştür. Çalışmanın sonucu olarak psbA-trnH IGS sekansınınmeşelerde barkodlama amacı ile tek başına yetersiz olduğu, bununla birlikte farklı barkodlama bölgeleri ilekullanımının fayda sağlayacağı önerilmektedir.

Açıklama

Anahtar Kelimeler

Kaynak

Düzce Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Dergisi

WoS Q Değeri

Scopus Q Değeri

Cilt

8

Sayı

1

Künye