Identification of Novel Mutations in Children with Hereditary Spherocytosis by Targeted Exome Sequencing: A Single Center Experience
Küçük Resim Yok
Tarih
2022
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Aim: Hereditary spherocytosis (HS) is a prevalent cause of congenital hemolytic anemia in Northern Europeans. It is characterized by spherocytes resulting from defects in the erythrocyte structural membrane proteins spectrin and ankyrin. To date, more than five candidate genes, including ANK1, SPTB, SPTA1, SLC4A1, and EPB42 have been linked to HS. Here, we aim to investigate the presence of novel as well as known mutations in eight Turkish children with clinically suspected HS. Material and Methods: We presented the clinical features of the patients and identified the causative gene variants using targeted exome sequencing. Eight children who were clinically suspected of having HS enrolled in this study. A family and medical history, clinical examination, relevant laboratory test results, osmotic fragility test (OFT), and genetic results were evaluated. Results: Six causative variants, including three ANK1 variants, two SPTB variants and one SLC4A1 variant were detected. All these mutations were novel variants. ANK1 and SPTB are the most common mutant genes in children with HS. Conclusion: This study expanded the mutation spectrum of ANK1, SPTB and SLC4A1. This is the first study to determine the genetic and clinical characteristics of children with HS in Turkey.
Amaç: Kalıtsal sferositoz (HS), Kuzey Avrupalılarda konjenital hemolitik aneminin yaygın bir nedenidir. Eritrosit yapısal membran proteinleri spektrin ve ankirin’deki kusurlardan kaynaklanan sferositlerle karakterizedir. Bugüne kadar, ANK1, SPTB, SPTA1, SLC4A1 ve EPB42 dahil olmak üzere beşten fazla aday gen, HS ile ilişkilendirilmiştir. Burada, klinik olarak HS şüphesi olan sekiz Türk çocuğunda bilinen ve yeni mutasyonların varlığını araştırmayı amaçladık. Gereç ve Yöntemler: Hastaların klinik özelliklerini sunduk ve hedeflenen ekzom dizilimi kullanarak nedensel gen varyantlarını belirledik. Klinik olarak HS olduğundan şüphelenilen sekiz çocuk bu çalışmaya alındı. Aile ve tıbbi öykü, klinik muayene, ilgili laboratuvar test sonuçları, ozmotik frajilite testi ve genetik sonuçlar değerlendirildi. Bulgular: Üç ANK1 varyantı, iki SPTB varyantı ve bir SLC4A1 varyantı dahil olmak üzere 6 nedensel varyant tespit edildi. Bütün bu mutasyonlar yeni varyantlardı. ANK1 ve SPTB, HS’li çocuklarda en sık görülen mutant genlerdir. Sonuç: Bu çalışma, ANK1, SPTB ve SLC4A1 genlerinin mutasyon spektrumunu genişletti. Bu, Türkiye’de HS’li çocukların genetik ve klinik özelliklerini belirleyen ilk çalışmadır.
Amaç: Kalıtsal sferositoz (HS), Kuzey Avrupalılarda konjenital hemolitik aneminin yaygın bir nedenidir. Eritrosit yapısal membran proteinleri spektrin ve ankirin’deki kusurlardan kaynaklanan sferositlerle karakterizedir. Bugüne kadar, ANK1, SPTB, SPTA1, SLC4A1 ve EPB42 dahil olmak üzere beşten fazla aday gen, HS ile ilişkilendirilmiştir. Burada, klinik olarak HS şüphesi olan sekiz Türk çocuğunda bilinen ve yeni mutasyonların varlığını araştırmayı amaçladık. Gereç ve Yöntemler: Hastaların klinik özelliklerini sunduk ve hedeflenen ekzom dizilimi kullanarak nedensel gen varyantlarını belirledik. Klinik olarak HS olduğundan şüphelenilen sekiz çocuk bu çalışmaya alındı. Aile ve tıbbi öykü, klinik muayene, ilgili laboratuvar test sonuçları, ozmotik frajilite testi ve genetik sonuçlar değerlendirildi. Bulgular: Üç ANK1 varyantı, iki SPTB varyantı ve bir SLC4A1 varyantı dahil olmak üzere 6 nedensel varyant tespit edildi. Bütün bu mutasyonlar yeni varyantlardı. ANK1 ve SPTB, HS’li çocuklarda en sık görülen mutant genlerdir. Sonuç: Bu çalışma, ANK1, SPTB ve SLC4A1 genlerinin mutasyon spektrumunu genişletti. Bu, Türkiye’de HS’li çocukların genetik ve klinik özelliklerini belirleyen ilk çalışmadır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
ANK1|hereditary spherocytosis|pathogenic|SPTB|targeted exome sequencing|ANK1|kalıtsal sferositoz|patojenik|SPTB|hedeflenmiş ekzom dizilimi
Kaynak
Batı Karadeniz Tıp Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
6
Sayı
3
