CRISPR-Cas Fonksiyonel Genetik Tarama: Geleneksel Derleme
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2022
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Prokaryotlara ait savunma mekanizması bileşenleri kullanılarak ge- liştirilen düzenl i aralıklarla bölünmü ş kısa pal indromik tekrar kümeler i [clustered regularly interspaced palindromic repeats (CRISPR)-Cas] sistemi hedefe özgü gen düzenleme arac ı olarak in vitro ve in vivo çalışmalarda yaygın olarak kullan ılmaktadır. CRISPR-Cas s isteminin kullanım alanları arasında gen silme, gen ekleme, baz düzeltme, gen ifadesi düzenleme, ge- nomik lokusları görüntüleme, epigenetik düzenleme ve diagnostik analizler yer almaktadır. Bu s istemin güçlü özell ikleri arasında bulunan esnekl iği, çok yönlülüğü ve kolay uygulanab ilirliği kullanım alanlarının giderek art- masına yol açmıştır. Son yıllarda, genlerin biyolojik süreçler ve hücreseliş- levlerdeki rollerini aydınlatmak için de CRISPR-Cas9 temelli fonksiyonel genetik tarama çalışmaları yapılmaktadır. CRISPR taramaları, başta kanser olmak üzere, hastalığa bağlı olarak hücrelerin hayatta kalabilmeleri için ge- rekli olan, hastalık gelişiminden sorumlu genetik faktörlerin tanımlanması ve fonksiyonlarının belirlenmesi için kullanılmaktadır. Amaca uygun seçil- miş gRNA kütüphanesinin hazırlanması ve çoğaltılması, ilgili plazmide klonlama, lentivirüslere paketleme ve hücrelere lentiviral transdüksiyon, fe- notipik seçilim, yeni nesil DNA d izi analizi ve biyoinformatik analiz aşa- malarından olu şan CRISPR-Cas temell i taramalar, fonks iyonel genet ik çalışmalarının yüksek verimlilik ve doğrulukta yapılabilmesini mümkün kıl- mıştır. Patojen-konakçı etkileşimlerinin araştırılması, hastalıkların molekü- ler mekanizmalarının ortaya konmas ı, yeni tedavi hedeflerinin bulunması ve tedavi direncinde rol oynayan genetik faktörlerin belirlenmesi gibi farklı amaçlara yönelik tarama çal ışmaları da yapılabilmektedir. Bu derlemede, farklı CRISPR-Cas sistemleri kısaca özetlendikten sonra genetik tarama ça- lışmalarının temel mantığı, uygulanışı ve kullanım alanları güncel literatür- den seçilen örneklerle tartışılacaktır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Kaynak
Türkiye Klinikleri Tıp Bilimleri Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
42
Sayı
4
