Yazar "Karamurat, Zeynep Dilara" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 4 / 4
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Evaluation of Quality Assurance Indicators and Contamination Rate in Blood Culture(Duzce Univ, Fac Medicine, 2021) Oksuz, Sukru; Donmez, Betul; Keskin, Banu Humeyru; Memis, Nagihan; Karamurat, Zeynep Dilara; Caliskan, Emel; Sahin, IdrisObjective: Blood culture are of vital importance in patient follow-up, as they enable the identification and production of sepsis causative microorganisms, initiate antibiotic treatment in a timely manner and reduce mortality and morbidity. In this study, it is aimed to evaluate the microorganisms grown in the automated blood culture in the microbiology laboratory of the hospital in terms of quality indicators. Methods: In this study, microorganisms grown from automated blood culture BACTEC-9120 (Becton Dickinson, USA) system from the blood culture samples sent to Duzce University Medical Microbiology Laboratory were evaluated retrospectively. For this purpose, the rejection and contamination rate of the samples for which blood culture was requested, the result of Gram staining-final identification compliance, the number of samples sent from a single bottle, and the growth times of microorganisms after incubation were determined. Results: 5037 blood culture samples were sent to the laboratory from various clinics. 1.7% of these samples were rejected as inappropriate samples. Gram stain-final identification compatibility of blood cultures was investigated and it was determined as 97.8%. The single bottle number of the samples sent was found to be 511. For the 5037 samples included in the study, growth was detected in 20.7%, of which 10.2% were considered as contaminants In our study, the average breeding time of the factors examined for breeding time was determined to be 30.29 hours. Conclusions: As conclusion, there is no gold standard to distinguish true pathogens from contaminant agents in blood cultures.Öğe Identification of the Gram Positive Bacterial Sepsis Agent with Rapid Genotype Test(Duzce Univ, Fac Medicine, 2021) Erdogan, Ziya; Ozturk, Cihadiye Elif; Cangur, Sengul; Caliskan, Emel; Oksuz, Sukru; Karamurat, Zeynep DilaraObjective: An irreversible process begins when a systemic infection causes sepsis. Therefore, rapid identification of the agent bacteria in sepsis and its antibiotic resistance is crucially important. In this study, it was aimed to investigate the efficiency of rapid genotype test in detecting sepsis agent Gram positive bacteria and important antibiotic resistance. Methods: 2132 blood culture samples sent to the laboratory were examined with an automatic blood culture system (BACTEC, BD, USA) between 2018-2019. Blood culture bottles sent to the laboratory were Growing bacteria was identificated by VITEK (bioMerieux, France) automated bacteria identification / antibiotic susceptibility system. In addition, bacterial species and mecA, vanA, vanB, vanC1, vanC2 / C3 genes in blood cultures with Gram positive bacterial growth were also determined by the Genotype (R) BC Gram-positive (Hain Lifesience, Germany) test. Results: 72 patients with gram-positive bacteria growth in two or more blood culture bottles were included in the study. In 44 of the samples (61%) the same bacterial species were detected with conventional method (bacteria culture) and BC Gram positive test. In 28 of the samples (39%) differences were detected between results of methods regarding bacterial species name or vancomycin/methicillin resistance rate. Although single agent was isolated with culture method in all of the samples, multiple agents were detected in eight samples with rapid genotype test. Also, it was found that in mecA positive samples, ciprofloxacin resistance was higher than mecA negative ones. Conclusions: In the study, it was observed that BC Gram positive test could correctly identify sepsis agent bacteria and their resistance genes within 4-5 hours.Öğe İndirekt immünofloresan testi ile değerlendirilen otoantikor pozitifliklerine Şiddetli Akut Solunum Yolu Sendromu Koronavirüsü 2 pandemisinin etkisinin araştırılması(Hayat Sağlık ve Sosyal Hizmetler Vakfı, 2025) Karamurat, Zeynep Dilara; Çalışkan, Emel; Akbaş, Emel; Öksüz, Şükrü; Şahin, İdrisAmaç: Bu çalışmanın amacı Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) enfeksiyonu ile sistemik veya organa özgü otoimmün hastalıklar arasındaki olası ilişkiyi belirlemektir. Yöntemler: Çalışmamıza Mart 2018 ile Mart 2022 tarihleri arasında çeşitli kliniklerden, otoimmün hastalık ön tanısı olan hastalardan Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen serum örnekleri dâhil edildi. Bu dönemde laboratuvarımızda çalışılan indirekt immünofloresan antikor test sonuçları hastanemiz otomasyon sisteminden elde edilerek retrospektif olarak değerlendirildi. Bulgular: Coronavirus Disease 2019 (COVİD 19) pandemisinden önceki iki yılda ve pandemi dönemindeki iki yılda indirect immunofluorescence assay (IIAF) değerlendirmesi yapılan 8325 hastanın 2256’sında anti-nükleer antikor (ANA) pozitifliği saptandı [2038 hastada tekli patern (1363’ü benekli), 218 hastada çoklu patern]. Otoantikor pozitifliğinin zaman içindeki değişimi incelendiğinde, pandeminin ilk iki yıllık döneminde önceki iki yıla göre ANA, anti-double-stranded DNA antibody (anti-dsDNA), antigliadin,anti-islet cell antibody (anti -ICA) ve anti-Gliadin otoantikorlarının pozitiflik oranlarında istatistiksel olarak anlamlı bir artış olduğu tespit edildi. anti-mitochondrial antibody (AMA),, anti-smooth muscle antibody (ASMA), anti-Endomysium, anti-neutrophil cytoplasmic antibody (ANCA), otoantikorlarının ise pozitiflik oranlarında COVID-19 pandemi döneminde ve öncesinde farklılık gözlenmedi. Sonuç: Pandemi döneminde ANA, anti-dsDNA, anti-ICA, anti-Gliadin otoantikorlarının pozitiflik oranlarının artması, COVID-19 sürecinin bazı otoimmün hastalıkları etkileyebileceğini düşündürdü.Öğe İndirekt immünofloresan yöntemi ile değerlendirilen otoantikor pozitifliklerine SARS-COV-2 pandemi etkisinin araştırılması(Düzce Üniversitesi, 2023) Karamurat, Zeynep Dilara; Çalışkan, EmelAmaç: Çalışmamızın amacı, SARS-CoV-2 enfeksiyonu ile sistemik ve organ spesifik otoimmün hastalıklar arasındaki olası ilişkinin belirlenmesidir. Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza, Mart 2018-Mart 2022 tarihleri arasında Düzce Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na çeşitli kliniklerdeki hastalardan otoimmün hastalık şüphesi ile gönderilen serum örnekleri dahil edildi. İndirekt immunofloresan antikor parametreleri ve aynı hastalardan bu süreçte laboratuvarımızda COVID-19 PCR testi çalışılan örneklerin sonuçları, hastanemizin otomasyon sisteminden elde edilerek retrospektif olarak değerlendirildi. Bulgular ve sonuç: Çalışmaya, COVID-19 pandemi öncesi iki yıl ve pandemi dönemindeki iki yılda otoimmun hastalık şüphesiyle IIFA testi için mikrobiyoloji laboratuvarına serum örnekleri gönderilen 8325 hastadan herhangi bir otoantikoru pozitif saptanan 2448 hasta dahil edildi. ANA pozitifliği, toplam 2256 hastada saptanmış olup bunlardan 2038'inin tekli (1363'ü benekli patern), 218'inin çoklu patern olduğu görüldü. ANA testi çalışılmış ve COVID-19 PZR pozitifliği saptanmış olan hastaların 41'inde ANA pozitifliği tespit edilmiş olup patern olarak en sık benekli (%74) patern saptandı. Otoantikor pozitifliğinin zamana göre değişimini incelendiğinde ANA, anti-dsDNA, anti-ICA, anti-Gliadin otoantikorlarının pozitiflik oranlarında pandemi dönemini içeren iki yıllık sürede istatistiksel olarak anlamlı artışın olduğu tespit edildi. AMA, ASMA, anti-Endomisyum, ANCA otoantikorlarının pozitiflik oranlarında ise COVID-19 pandemi öncesi ve pandemisini içeren tüm dönemlerde fark olmadığı görüldü. Otoantikor pozitifliğine sahip hastaların, hastanemiz Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda çalışılmış COVID-19 PZR sonuçları incelendiğinde 323 hastanın COVID-19 PCR testinin pozitif, 306 hastanın ise negatif olduğu görüldü. ANAHTAR SÖZCÜKLER: İndirekt immunofloresan antikor yöntemi, otoantikor, otoimmün hastalıklar, SARS-CoV-2, COVID-19
