Yazar "Demir, Garip" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Cloning and expression heterologous alanine dehydrogenase genes: Investigation of reductive amination potential of L-alanine dehydrogenases for green synthesis of alanine derivatives
    (Cell Press, 2024) Demir, Garip; Valjakka, Jarkko; Turunen, Ossi; Aktas, Fatih; Binay, Baris
    Unnatural amino acids (UAAs) offer significant promise in a wide range of applications, including drug discovery, the custom design of peptides and proteins, and their utility and use as markers for monitoring molecular interactions in biological research. The synthesis of UAAs presents a formidable challenge and can be classified into two primary categories: enzymatic and chemical synthesis. Notably, the enzymatic route, specifically asymmetric synthesis, emerges as a an attractive method for procuring enantiopure UAAs with high efficiency, owing to its streamlined and concise reaction mechanism. The current study investigated the reductive amination activity mechanisms of alanine dehydrogenase (L-AlaDH), sourced from a combination of newly and previously characterized microorganisms. Our principal aim was to evaluate the catalytic efficiency of these L-AlaDH enzymes concerning a range of specific ketoacids and pyruvate to ascertain their capability for facilitating the production of both natural and unnatural amino acids. After the characterization processes, mutation points for TtAlaDH were determined and as a result of the mutations, mutants that could use ketocaproate and ketovalerate more effectively than the wild type were obtained. Among the enzymes studied, MetAlaDH exhibited the highest specific activity against pyruvate, 173 U/mg, and a KM value of 1.3 mM. VlAlaDH displayed the most favourable catalytic efficiency with a rate constant of 170 s- 1mM- 1. On the other hand, AfAlaDH demonstrated the highest catalytic efficiency against alpha-ketobutyrate (34.0 s- 1mM-1) and alpha-ketovalerate (2.7 s- 1mM-1). Of the enzymes investigated in the study, TtAlaDH exhibited the highest effectiveness among bacterial enzymes in catalyzing ketocaproate with a measured catalytic efficiency of about 0.6 s- 1mM-1 and a KM value of approximately 0.3 mM. These findings provide valuable insights into the substrate specificity and catalytic performance of L-AlaDHs, enhancing our understanding of their potential applications in various biocatalytic processes.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Yaşar Kemal romanlarında çocuk karakterlerin konumu
    (Düzce Üniversitesi, 2024) Demir, Garip; Aydın, Yahya
    Bu çalışma, Yaşar Kemal romanlarında çocuk karakterlerin konumunu tespit etmeyi amaçlamıştır. İncelemede, bu hedef doğrultusunda; romanlardaki çocukların özellikleri nelerdir, olay örgüsüne katkıları nasıldır, çevre-kültür etkileşimleri ne biçimde gerçekleşir; bu çocuklar gerçeklik ve kurmaca ilişkisinin neresinde bulunmaktadır, sorularına yanıt aranmıştır. Çukurova'yı ve İstanbul'u ayrı ayrı mekân olarak almaları ve genel kanıya ulaşabilmek açısından temsil kuvvetlerinin yüksek olması dolayısıyla yazarın Yılanı Öldürseler, Yağmurcuk Kuşu, Al Gözüm Seyreyle Salih, Kuşlar da Gitti adlı romanları, örneklem olarak seçilmiştir. Nitel bir çalışma olan bu araştırmada doküman incelemesi ve içerik analizi yöntemi ile adı geçen romanlar incelenmiştir. Giriş bölümünde problem durumu, çalışmanın önemi, araştırmanın amacı, sınırlılıkları, literatür değerlendirmesi; yöntem başlığı altında araştırmanın modeli, incelenen doküman ve verilerin analizine yönelik bilgi verilmiştir. Kuramsal çerçeve kısımda roman türünün ortaya çıkışı, Türk Edebiyatı'nda romanın gelişimi, roman ve gerçeklik ilişkisi ile romanın yapı unsurları; yazarın hayatı, sanatının kaynakları ve çocuklara bakış açısı incelenmiştir. Bulgular ve tartışma başlığı altında, örneklemi oluşturan romanlar incelenmiş, elde edilen veriler kuramsal bilgiler ışığında tartışılmıştır. Bu çerçevede elde edilen çıkarımlar, sonuç bölümünde aktarılmıştır. Buna göre Yaşar Kemal romanlarında çocukların bir çocuk gibi değil, büyükler gibi ele alındığı; çocuklara özgü davranışlar, oyunlar içinde olmadıkları; formel bir eğitim öğretim faaliyetinin içinde yer almadıkları; doğal olmayan ölümlere şahit oldukları; psikolojik olarak atlatılması zor olayları en az etkilenme ile atlattıkları; çevresi ile ilişkilerinin sınırlı olduğu; yalnızlık duygusunu derinden hissettikleri; toplumsal baskılara maruz kaldıkları; yazarın hayatından izler taşıdıkları sonucuna ulaşılmıştır.